培养目标：
培养具有良好思想道德和职业素养，掌握生物制药基础理论、基本知识和基本技能，具备生物工程、生物技术、药学等方面的知识和能力，胜任生物药品的研发、生产、质量控制、经营管理等方面工作，能够入基层、进一线的高素质应用型生物制药专门人才。
主干课程：
无机化学、有机化学、分析化学、仪器分析、生物化学、微生物学、分子生物学、细胞生物学、药理学、细胞工程、基因工程、发酵工程、生物分离工程、蛋白质工程、分子诊断技术、药剂学、基因蛋白质药物生产技术。
就业方向：
生物医药企业、科研院所。
校企（院）合作：
生物制药专业与台湾中华科技大学合作办学，与厦门海沧生物科技发展有限公司签订共建实践育人创新创业基地战略合作协议，与二十余家厦门生物医药企业及多个科研院所建立校企（院）合作关系，在课程建设、师资培养、实习就业等方面进行全方位合作。
实验室条件及成果：
生物制药专业现有实验室面积3101平方米，包括生物制药GMP车间、药物制剂GMP车间、化学与生物化学实验室、有机化学实验室、基因工程实验室、发酵工程实验室、细胞工程实验室、生物分离工程实验室、生物药品检测实验室、无菌操作室等，并依托福建省道地药材药材生物工程重点实验室、厦门市药用植物生物工程重点实验室、厦门市海洋医用天然产物与细胞工程重点实验室和校中心实验室，以科研带动教学。现有教学仪器设备总值3579万元，配备流式细胞仪、实时定量PCR仪、发酵罐、超滤系统、层析系统、高速冷冻离心机、管式流离心机、电子显微镜、酶标仪、自动核酸蛋白质层析分离仪、液相色谱仪/质谱联用仪等设备，保证学生具有足够的实训工位数进行生物制药行业现代设备实训。
